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Mapeo COVID19
Fuente: Por Lauren Gardner,
Referencia: Dong E, Du H, Gardner L. Un tablero interactivo basado en la web para rastrear COVID-19 en tiempo real. Lancet Infect Dis ; publicado en línea el 19 de febrero. https://doi.org/10.1016/S1473-3099
Antecedentes
El 31 de diciembre de 2019, la Organización Mundial de la Salud ( OMS ) fue informada de un brote de «neumonía de causa desconocida» detectado en la ciudad de Wuhan, provincia de Hubei, China, la séptima ciudad más grande de China con 11 millones de residentes. Hasta el 23 de enero, hay más de 800 casos de 2019-nCoV confirmados a nivel mundial, incluidos casos en al menos 20 regiones en China y nueve países / territorios. Se descubrió que los primeros individuos infectados reportados, algunos de los cuales mostraban síntomas desde el 8 de diciembre , se encontraban entre los vendedores del mercado de mariscos de Wuhan en el sur de China. Posteriormente, el mercado húmedo se cerró el 1 de enero. Se determinó rápidamente que el virus que causaba el brote era un nuevo coronavirus.. El 10 de enero, la secuenciación de genes determinó que era el nuevo coronavirus de Wuhan, es decir, 2019-nCoV , un betacoronavirus, relacionado con el virus del Síndrome Respiratorio del Medio Oriente (MERS-CoV) y el virus del Síndrome Respiratorio Agudo Severo (SARSCoV). Sin embargo, la mortalidad y la transmisibilidad de 2019-nCoV aún se desconocen, y es probable que varíen de las de los coronavirus referenciados anteriormente.
Se sabe que los viajeros infectados (principalmente el aire) son responsables de la introducción del virus fuera de Wuhan. El 13 de enero, Tailandia informó el primer caso internacional fuera de China, mientras que los primeros casos dentro de China, pero fuera de Wuhan, se informaron el 19 de enero, en Guangdong y Beijing. El 20 de enero, la Comisión Nacional de Salud (NHC) de China confirmó que el coronavirus puede transmitirse entre humanos . El mismo día también se confirmaron infecciones en humanos con 2019-nCoV en Japón y Corea del Sur , y al día siguiente casos en los EE. UU. Y Taiwán fueron detectados en viajeros que regresan de Wuhan. El 21 de enero, varias provincias de China también informaron nuevos casos y se confirmó la infección en 15 trabajadores de la salud , con seis muertes reportadas. Se han confirmado casos de viaje adicionales en Hong Kong , Macao , Singapur y Vietnam. El 22 de enero, un comité de emergencia de la OMS se reunió para discutir si el brote debería clasificarse como una emergencia de salud pública de interés internacional ( PHEIC ) según el Reglamento Sanitario Internacional , pero inicialmente no se decidió debido a la falta de información, antes de decidir en contra de la declaración.
Una preocupación inmediata es el riesgo de una mayor transmisión como resultado de los altos volúmenes de viajes y las reuniones masivas en celebración del Año Nuevo chino el 24 de enero. En un intento por mitigar la transmisión local dentro de China, se implementaron estrategias de control de brotes sin precedentes en (inicialmente) tres ciudades. El 23 de enero de 2020, Wuhan suspendió todo el transporte público y los viajes aéreos (dentro y fuera de la ciudad), colocando a los 11 millones de residentes de la ciudad en cuarentena . El 24 de enero, Huanggang y Ezhou , ciudades adyacentes a Wuhan, también serán sometidas a una cuarentena similar, con más ciudades en China que ahora siguen su ejemplo. Además, muchas ciudades han cancelado las celebraciones del Año Nuevo chino.
Como Wuhan es un importante centro de transporte aéreo en el centro de China, se han tomado varias medidas a escala mundial para mitigar la propagación internacional. La detección selectiva en el aeropuerto de los pasajeros que viajan desde Wuhan se inició el 1 de enero en Hong Kong y Macao. Taiwán, Singapur y Tailandia comienzan a evaluar a los pasajeros que llegan el 3 de enero. En los EE. UU., Los CDC comenzaron a evaluar la entrada de pasajeros en vuelos directos y de conexión desde Wuhan a los tres principales puertos de entrada el 17 de enero de 2020, con Atlanta y Chicago pronto para ser agregado. El 23 de enero, los CDC de EE. UU. Elevaron su aviso de viaje a Wuhan, China, al más alto de los tres niveles. Otros países del Pacífico y Asia, como Malasia, Sri Lanka, Bangladesh y la India, ahora también están realizando controles selectivos de pasajeros en los aeropuertos.
Panel de SIG (actualizado el 11 de febrero de 2020)
En respuesta a esta emergencia de salud pública en curso, desarrollamos un tablero interactivo basado en la web (se muestra una instantánea estática arriba) alojado por el Centro de Ciencia e Ingeniería de Sistemas (CSSE) en la Universidad Johns Hopkins, para visualizar y rastrear casos reportados en tiempo real . El tablero, que se compartió públicamente por primera vez el 22 de enero, ilustra la ubicación y el número de casos confirmados de COVID-19, muertes y recuperaciones para todos los países afectados. Fue desarrollado para proporcionar a los investigadores, las autoridades de salud pública y el público en general una herramienta fácil de usar para rastrear el brote a medida que se desarrolla. Además, todos los datos recopilados y mostrados se ponen a disposición de forma gratuita, inicialmente como hojas de Google, ahora en un repositorio de GitHub, junto con las capas de funciones del tablero, que ahora se incluyen en ESRI Living Atlas.
El tablero informa casos a nivel de provincia en China, a nivel de ciudad en los Estados Unidos, Australia y Canadá, y a nivel de país de lo contrario. Del 22 al 31 de enero, toda la recopilación y procesamiento de datos se gestionó manualmente. Durante este período, el número de actualizaciones generalmente se realizaba dos veces al día, tanto en la mañana como en la noche (hora del este). A medida que el brote evolucionó, el proceso de informes manuales se volvió insostenible y el 1 de febrero, adoptamos una estrategia de flujo de datos vivos semiautomatizada. Nuestra fuente de datos primaria es DXY, una plataforma en línea administrada por miembros de la comunidad médica china, que agrega los medios locales y los informes del gobierno para proporcionar los totales de casos acumulados de COVID-19 en tiempo casi real a nivel de provincia en China y en otros países. Cada 15 minutos, los recuentos de casos acumulados se actualizan desde DXY para todas las provincias de China y los países y regiones afectados. Para los países y regiones fuera de China continental (incluidos Hong Kong, Macao y Taiwán), encontramos que los recuentos de casos acumulados DXY con frecuencia retrasan otras fuentes; por lo tanto, actualizamos manualmente estos números de casos a lo largo del día cuando se identifican nuevos casos. Para identificar nuevos casos, monitoreamos varios feeds de Twitter, servicios de noticias en línea y comunicación directa enviada a través del tablero. Antes de actualizar manualmente el tablero,CCDC ), el Departamento de Salud de Hong Kong , el Gobierno de Macao , los CDC de Taiwán , los CDC europeos ( ECDC ), la Organización Mundial de la Salud ( OMS ), así como las autoridades sanitarias a nivel municipal y estatal. Para los informes de casos a nivel de ciudad en los EE. UU., Australia y Canadá, que comenzamos a informar el 1 de febrero, confiamos en los CDC de los EE. UU., El Gobierno de Canadá , el Departamento de Salud del Gobierno de Australia y varias autoridades de salud estatales o territoriales . Todas las actualizaciones manuales (fuera de China continental) son coordinadas por un equipo de JHU.
Actualmente estamos en el proceso de realizar modelos adicionales de este brote emergente, y actualizaremos esta publicación de blog con los resultados pronto.